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姜 颖
2015-06-10 12:10:26   浏览次数:0  文字大小:【】【】【

欢迎来到功能蛋白质组实验室

 

 

研究方向
      实验室主要研究领域:肝脏重要生理、病理过程相关的蛋白质组研究。
 
       关注两个重要方向:1)肝脏蛋白质组参比图谱的构建; 2)重大肝病的比较蛋白质组研究。

发表代表性论文
一、     肝脏蛋白质参比图谱构建代表性论文:
(一)建立了国际规范标准的肝脏蛋白质组研究的样本采集、存储及制备肝脏组织、肝脏细胞、亚细胞)操作流程。首次证实成人健康肝脏蛋白质组的表达水平相对稳定(平均CV 19%
 
1.       Zhang X, Guo Y, Song Y, Sun W, Yu C, Zhao X, Wang H, Jiang H, Li Y, Qian X, Jiang Y*, He F*. Proteomic Analysis of Individual Variation of Normal Liver in Human Being Using Difference Gel Electrophoresis. Proteomics. 2006,6:5260-8. (IF 5.735, *通讯作者)
 
2.       Song Y, Hao Y, Sun A, Li T, Li W, Guo L, Yan Y, Geng C, Chen N, Zhong F, Wei H, Jiang Y,* He F*. Sample preparation project for the subcellular proteome of mouse liver. Proteomics. 2006,6:5269-77. (IF 5.735, *通讯作者)
 
3.       Song Y, Jiang Y*, Ying W, Gong Y, Yan Y, Yang D, Ma J, Xue X, Zhong F, Wu S, Hao Y, Sun A, Li T, Sun W, Wei H, Zhu Y, Qian X, He F*. Quantitative proteomic survey of endoplasmic reticulum in mouse liver. J Proteome Res. 2010, 9: 1195-202. (IF 5.46, *通讯作者)
 
4.       Liu W, Hou Y, Chen H, Wei H, Lin W, Li J, Zhang M, He F*, Jiang Y*. Sample preparation method for isolation of single cell types from mouse liver for proteomic studies. Proteomics. 2011, 11:3556-64 (IF 4.815, *通讯作者)
 
(二)构建了首个人体器官(肝脏)蛋白质表达图谱及公众共享的数据资源Liverbase网站(http://liverbase.hupo.org.cn),提供了人肝脏表达蛋白质的丰度、功能及疾病相关性的完整注释。为肝脏疾病研究提供蛋白质参比图谱。
 
5.        Jiang Y*, Ying W*, Wu S*, Chen M*, et al ,.,First insight into human liver proteome from PROTEOMESKY-LIVERHu 1.0, a publicly-available database. J Proteome Res. 2010, 9: 79-94. (IF 5.46*第一作者)
 
6.         Sun A, Jiang Y*, Wang X, Liu Q, Zhong F, He Q, Guan W, Li H, Sun Y, Shi L, Yu H, Yang D, Xu Y, Song Y, Tong W, Li D, Lin CL, Hao Y, Geng C, Yun D, Zhang X, Yuan X, Chen P, Zhu Y, Li Y, Liang S, Zhao XH, Liu S, He F*. Liverbase: a comprehensive view of human liver biology. J Proteome Res. 2010, 9: 50-8. (IF 5.46*通讯作者)
 
2010年,Nature Methods.(第7卷, 681-5页)评价此项工作为国际人类蛋白质组计划的实施奠定了重要基础。构建的数据共享平台,已用于多个国际重要蛋白质组数据库(欧洲生物信息学研究所数据库、美国系统生物学研究所和美国标准技术局)建设。
 
(三)揭示胎肝具有的肝脏发育和造血双重功能的蛋白质组分子特征:发现含有KRAB结构域的蛋白质在胎脏中高比例表达,强烈提示它们与胎肝旺盛的发育和造血有关
 
7.       Ying W*, Jiang Y*, Guo L*, et al. A Dataset of Human Fetal Liver Proteome Identified by Subcellular Fractionation and Multiple Protein Separation and Identification Technology. Mol Cell Proteomics. 2006,5:1703-7. (IF 9.62*第一作者)
 
8.       Guo Y, Zhang X, Huang J, ZengY, Liu W, Geng C, Li KW, Yang D, Wu S, Wei H, Han Z, Qian X, Jiang Y, He F. Relationships between Hematopoiesis and Hepatogenesis in the Midtrimester Fetal Liver Characterized by Dynamic Transcriptomic and Proteomic Profiles. Plos One. 2009, 4(10): e7641. doi:10.1371/journal.pone.0007641 (IF 4.351*通讯作者)
 
(四)通过海量蛋白质组数据,发现多物种间蛋白质丰度整体分布规律及促成生物学复杂性的蛋白质结构域特征。为今后更加合理有效的利用组学数据进行理论生物学研究提供了方法和思路。
 
9.       Zhong F*, Yang D*, Hao Y*, Lin C*, Jiang Y, Ying W, Wu S, Zhu Y, Liu S, Yang P, Qian X, He F.  Regular patterns for proteome-wide distribution of protein abundance across species. PLoS One. 2012;7(3):e32423. (IF 4.411*第一作者)
 
10. Yang D, Zhong F, Li D, Liu Z, Wei H, Jiang Y*, He F*. General Trends in the Utilization of Structural Factors Contributing to Biological Complexity. Mol Biol Evol. 2012, 29: 1957-68  (IF 10.353, *通讯作者)
 
11. Ma JLi WLv YChang CWu SSong LDing CWei HHe F*, Jiang Y*, Zhu Y*. A new insight into the impact of different proteases on SILAC quantitative proteome of the mouse liver. Proteomics. 2013,13: 2238–42 (IF 4.132, *通讯作者)
 
 
二、 重大肝病比较蛋白质组研究代表性论文:选择重大肝病从蛋白质组层面探索疾病发生发展机制及发现早期诊断标志物。
 
(一)揭示非酒精性脂肪性肝病发生的始动代谢因素,发现ECHS1为致肝细胞脂肪变的重要因子,及NAFLD病程相关诊断标志物。ECHS1对肝细胞脂肪变的调控作用已获中国发明专利授权(专利号:ZL 2009 1 0237604.7)
 
13. Zhang X, Yang J, Guo Y, Ye H, Yu C, Xu C, Xu L, Wu S, Sun W, Wei H, Gao X, Zhu Y, Qian X, Jiang Y*, Li Y*, He F*. Functional proteomic analysis of nonalcoholic fatty liver disease in rat models: ECHS1 down-regulation exacerbate hepatic steatosis. Hepatology. 2010,51: 1190-9 (IF 10.885, *通讯作者)
 
 
(二)证实HSPsHSP90HSP60HSP70)以多伴侣分子复合体形式参与HBV的生命活动。其中伴侣分子HSP90HSP70可能成为HBV感染相关疾病的治疗靶点。
 
15. Liu K, Qian L, Li W, Deng X, Chen X, Sun W, Wei H, Qian X, Jiang Y*, He F*. Two-dimensional blue native/SDS PAGE analysis reveals HSPs chaperone machinery involved in HBV production in HepG2.2.15 cells. Mol Cell Proteomics. 2009,8:495-505. (IF 8.791*通讯作者)
 
(三)首次建立肝组织间隙液提取方法,发现并验证肝细胞癌发生、转移候选诊断标志蛋白群。为寻找血液中新的蛋白标志物、建立肿瘤早期诊断和治疗的方法提供了新的思路。
 
16. Sun W, Xing B, Sun Y, Du X, Lu M, Hao C, Lu Z, Mi W, Wu S, Wei H, Gao X, Zhu Y, Jiang Y, Qian X, He F*. Proteome analysis of hepatocellular carcinoma by two-dimensional difference gel electrophoresis: novel protein markers in hepatocellular carcinoma tissues. Mol Cell Proteomics. 2007,6:1798-808. (IF 9.425*通讯作者) 单篇SCI引用已达73
 
17. Sun W, Ma J, Wu S, Yang D, Yan Y, Liu K, Wang J, Sun L, Chen N, Wei H, Zhu Y, Xing B, Zhao X, Qian X, Jiang Y*, He F*. Characterization of the liver tissue interstitial fluid (TIF) proteome indicates potential for application in liver disease biomarker discovery. J Proteome Res. 2010, 9: 1020-31. (IF 5.46*通讯作者)
 
18. Chen N, Sun W, Deng X, Hao Y, Chen X, Xing B, Jia W, Ma J, Wei H, Zhu Y, Qian X, Jiang Y*, He F*. Quantitative proteome analysis of HCC cell lines with different metastatic potentials by SILAC. Proteomics 2008, 8: 5108-18 (IF4.586*通讯作者)
 
实验室成员

实验室照片

规范化蛋白质组研究的样品制备技术:建立了规范化的生物样本存储系统、通量化复杂样品的蛋白质
分级分离系统 ,设有大型仪器设备间、生物化学实验室及P2级生物安全实验室。
     
                                                                高通量电泳及电转系统/全自动酶切点靶系统

 

  

                            蛋白质组学中的核心质谱技术
                              MALDI-TOF-TOF-MS
                               ESI-Q-TOF-MS
                              ESI-Ion Trap -LTQ-FT-MS
  
实验室活动照片

                      201255实验室成员参加第六届亚太蛋白质组大会
                     2011122实验室工作讨论时,下了那年冬天的第一场雪
                  201012月课题组骨干到成都参加人类基因组注释973项目研讨会
                              20101月课题组组织大家参加滑雪运动
                      20097月课题组成员到泰州参加第六届中国蛋白质组学大会,
              会后到扬州旅游

                 20097月课题组成员到扬州一日游。[实验室武(五)杰]

20087古巴基因工程与生物技术中心的Aniel Sanchez Puente到课题组顺利完成其

博士后研究,与实验室成员合影

                 20064月,课题组成员赴上海,参加肝脏蛋白质表达谱项目研讨会

                                             20061月,年度总结后合影

20061月,北京蛋白质组研究中心举办的迎春文艺联欢会上,我组同学表演舞蹈

“好一朵茉莉花”

                    200510月,课题组正式入驻北京蛋白质组研究中心

                       20057月,课题组成员赴长春参加第二届中国蛋白质组大会

2005210,课题组成员奋战一天一夜,在大年初二的早上7点,顺利完成中国人类肝脏蛋白质计划肝脏样本的制备任务

实验室资源连接

 1. Liverbase http://liverbase.hupo.org.cn/人类肝脏蛋白质组数据库

 

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